«Фермент-портал»: новый ресурс свободного доступа для исследователей

Источник: physorg.com

Во Всемирной паутине появился еще один сайт, предназначенный для ученых и исследователей. Это «фермент-портал» (Enzyme Portal), на котором собрано максимальное количество информации об известных белках с ферментативной активностью. Авторами проекта являются специалисты Европейской лаборатории молекулярной биологии Европейского института биоинформатики (EMBL-EBI). Ферменты играют важную роль в жизни человека и животных — они катализируют множество реакций и вызывают необходимые химические изменения. Отсутствие в организме некоторых энзимов может привести к тяжелым заболеваниям и даже смерти.

До сих пор данные о ферментах были рассеяны по множеству ресурсов, что тормозило работу ученых и препятствовало совершению открытий. Теперь максимум известных сведений собран в одном месте. На портале имеются данные из базы знаний UniProt, европейского Protein Data Bank, Rhea (БД реакций с участием ферментов); БД биохимических путей; IntEnz (БД номенклатуры ферментов); ChEBI и ChEMBL (базы информации о химическом составе молекул и биологической активности ферментов). Как отмечает куратор проекта Паула де Матос, решения о дизайне ресурса принимались на основе пожеланий пользователей, благодаря свободному тестированию и системе обратной связи.

Единая система поиска позволяет получить по запросу с названием фермента самые разнообразные сведения. А именно: классификацию вещества; последовательности реакций и путей с его участием; небольшую информацию о молекуле энзима; связанные с ним болезни и список литературы. Что особенно важно, на портале имеются данные по большому числу видов (включая человека). В том числе по животным, используемым в биологических исследованиях. И пользователи могут сравнить параметры деятельности ферментов у разных организмов. Доступ к ресурсу совершенно свободный и открытый, он находится по адресу: ebi.ac.uk/enzymeportal.